Jag har hittat problemen. Dels hade jag tidigare någon gång tydligen råkat kopiera in DgMap under DgPic, så den fanns två ex. Tydligen kom bara det felaktiga exet med i säkerhetskopieringen. Dels låg mina nya bmp-filer i den "rätta" DgMap, och kom därför inte med över.
Frågan kvarstår dock varför backupen tog med fel mapp, och inte båda?
Jag har nu också testat att konvertera en kartfil från bmp till jpg, och sedan gå in i map.ini och ändra filnamnet. Det gick utmärkt. Även att ändra andra parametrar för kartan. Tydligen är detta det enklaste sättet att fixa småfel på.